Responsable de maladies infectieuses les microorganismes (virus, parasites bactéries et champignons) sont également à l’origine de nombreuses épidémies (Ebola, Paludisme) et constituent de ce fait des données importantes pour le patient et en santé publique. L'utilisation d’un référentiel national pour décrire les agents infectieux bénéficie au biologiste, au clinicien pour adapter les réponses thérapeutiques et aux services de santé publique en facilitant l’agrégation de données épidémiques ou d’antibiorésistance. 

L’adoption d’un vocabulaire commun répondant aux besoins de l'écosystème est essentiel pour atteindre l’interopérabilité des flux d’information mais également favoriser l’exploitation des données.  Aussi face à un choix entre deux terminologies concernant les microorganismes (NCBI Taxonomy et SNOMED-CT – voir les documents annexes). La Délégation ministérielle au numérique en santé et l'Agence du Numérique en Santé souhaitent lancer une concertation auprès de l’écosystème. 

La concertation se tiendra tout au long du mois de mars 2022 sous la forme d'un questionnaire en trois parties : 

• Partie 1 : description du répondant et de l’organisation existante des données dans les Systèmes d’information (anatomie ou microorganismes)
• Partie 2 (optionnelle) : expression des besoins métiers et priorisation des critères de sélection du vocabulaire microbiologique ou anatomique. 
• Partie 3 : expression ouverte sur la concertation et les deux référentiels concertés.

La DNS et l’ANS vous remercient par avance à l’intérêt que vous apporterez à ce sujet, et de votre contribution à cette participation.