Le Répertoire Partagé des Professionnels intervenant dans le système de Santé contient les données d’état civil, de contact et des données sectorielles (diplômes, activités professionnelles, lieu d’exercice …). Le RPPS est alimenté par trois types d'autorités d’enregistrement, selon des règles bien précises : les ordres professionnels (CNOM, ONI, ONCD, CNOSF, CNOP, CNOMK, ONPP), les ARS (ex-professions ADELI) et les employeurs (structures des secteurs sanitaire ou médico-social). Un identifiant unique et pérenne est attribué à chaque professionnel : le numéro RPPS. Le RPPS contribue à la coordination des soins en fournissant une identité numérique à chaque professionnel, ce qui améliore la collaboration entre les différents acteurs du système de santé. Le RPPS joue un rôle important pour identifier les acteurs producteurs de données. Le RPPS est aussi utilisé à des fins statistiques pour les études épidémiologiques et la planification des soins. Enfin l’inscription au RPPS est obligatoire pour obtenir un MIE fourni par l'ANS comme la carte CPS, permettant notamment l’accès aux services numériques en santé et la facturation électronique. Les données du RPPS sont publiées dans l’Annuaire Santé.

Le FIchier National des Etablissements Sanitaires et Sociaux permet de fournir une identité numérique aux établissements des secteurs sanitaire, social et médico-social, et aux établissements de formation des professionnels. Les autorités d’enregistrement du FINESS sont les ARS, les DREETS et la DRHIL. Un identifiant unique et pérenne est attribué à chaque structure enregistrée dans le FINESS : le numéro FINESS. Ce numéro est obligatoire pour la facturation des soins auprès de l’Assurance Maladie, les demandes d’agréments et la fourniture de certificats logiciels (IGC-Santé) pour l’accès aux services numériques de santé.  Les données du FINESS sont publiées directement par l’application. Certaines données sont mises en relation avec les données du RPPS et publiées dans l’Annuaire Santé.

L’Annuaire Santé est un service de publication des données du RPPS, du FINESS, des bénéficiaires des cartes CPS et des certificats IGC-Santé des personnes morales. L’Annuaire Santé contient aussi les adresses MSSanté des professionnels de santé et d’organisations attachées à des personnes morales, et les adresses des boîtes aux lettres applicatives. Les données de ces différentes sources sont consolidées dans une seule base. Elles sont publiées via le site web annuaire.sante.fr et accessibles par des extractions quotidiennes. Les données sont aussi accessibles via des API FHIR. L’Annuaire Santé est le point de sortie unique des données sectorielles. Les données sont consommées par la majorité des services numériques nationaux (SI SAMU, Mon espace santé, ROR...) et par une grande variété d'acteurs de la e-santé en France (ENS, GRADeS, CNAM, établissements sanitaires et ESSMS...).